Das wissenschaftliche Hauptanliegen der Arbeitsgruppe ist es, zum Verständnis der komplexen Wechselwirkungen zwischen der menschlichen Lungenschleimhaut und der Umwelt sowohl im gesunden Zustand als auch bei Krankheit beizutragen. Dabei liegt ein besonderer Fokus auf Signalwegen und Netzwerken von C-Lektinen und CEACAM-Rezeptoren. Neben Bakterien konzentriert sich die Forschergruppe zudem auf Pilze als Kommensalen und potenzielle Pathogene der humanen Lunge.

Seit Februar 2020 konnte die AG ein Illumina-Sequenziergeräte der neuesten Generation einwerben. Wir können nun Multigenpanel-Analysen, Whole-Exome-Analysen und Whole-Genome-Analysen effizient durchgeführen. In Kombination mit der 16S-rRNA- und ITS-Sequenzierung ist es nun auch möglich, das gesamte Genom einer mikrobiellen Population mit hoher Auflösung zu sequenzieren und Analysen zu funktionellen Aspekten des Mikrobioms in die Forschungsarbeiten zu integrieren.

Kontakt

Prof. Dr. Hortense Slevogt
Albert-Einstein-Str. 10
07745 Jena

Die Host Septomics-Forschergruppe für Infektions- und Mikrobiomforschung ist Bestandteil des interfakultären Zentrums für Innovationskompetenz (ZIK) Septomics.

AG Host Septomics

Forschungsprojekte

Frühe bakterielle Besiedlung bei Neugeborenen

Projektleiterin: Prof. Dr. Hortense Slevogt
BMBF (InfectControl2020) 2016 - 2020

In diesem Projekt untersuchten wir die Darm-, Mund- und Haut-Mikrobiota von Neugeborenen innerhalb der ersten 72 h nach der Geburt mittels metagenetischer Sequenzierungen. In diesem sehr frühen Zeitfenster zeigte die taxonomische Analyse der Neugeborenenproben signifikante Veränderungen der Mikrobiota mit einem deutlichen, lokalitätsspezifischen Kolonisationsmuster. Darüber hinaus konnten wir einen beträchtlichen Erwerb von Antibiotikaresistenzgenen (ARGs) während des postpartalen Krankenhausaufenthalts nachweisen, verbunden mit einer sehr hohen Inzidenz von Makrolid-Resistenzdeterminanten und dem Nachweis von mecA an verschiedenen Körperstellen der Neugeborenen. Diese Studie unterstreicht die Bedeutung der Verbreitung von Antibiotikaresistenz-Determinanten bei Neugeborenen während des Krankenhausaufenthalts und die Notwendigkeit, die Implikation der Mütter und der Krankenhausumgebung als potenzielle Quellen von ARGs zu untersuchen (Klassert et al., 2020).

Weitere Projektinformationen

CEACAM-Rezeptorbindung steigert die durch Candida albicans induzierte Zytokinproduktion menschlicher Neutrophilen

Projektleiterin: Prof. Dr. Hortense Slevogt
DFG (TRR 124) 2017 - 2021

Dieses Projekt innerhalb des Collaborative Research Center/Transregio 124 – FungiNet (A5) hat den Effekt der Antikörper-Ligation von CEACAM1, CEACAM3 und CEACAM6 auf die Immunantwort humaner Neutrophiler gegen C. albicans untersucht. Wir haben gezeigt, dass die Ligation von jedem der drei Rezeptoren die Ausschüttung von CXCL8, IL-6 und IL-1b Antikörper-spezifisch erhöht hat. Die Ligation von CEACAM6 hat auch die C. albicans-induzierte Apoptose verstärkt, welche ebenso wie die de novo-Synthese von Zytokinen durch eine integrale Netzwerkanalyse von Transkriptom-Sequenzen vorhergesagt wurde (Klaile et al., 2019).

Weitere Projektinformationen

Ausgewählte Publikationen

Cho SX, Rudloff I, Lao JC, Pang MA, Goldberg R, Bui CB, McLean CA, Stock M, Klassert TE, Slevogt H, Mangan NE, Cheng W, Fischer D, Gfroerer S, Sandhu MK, Ngo D, Bujotzek A, Lariviere L, Schumacher F, Tiefenthaler G, Beker F, Collins C, Kamlin COF, König K, Malhotra A, Tan K, Theda C, Veldman A, Ellisdon AM, Whisstock JC, Berger PJ, Nold-Petry CA, Nold MF. (2020) Characterization of the pathoimmunology of necrotizing enterocolitis reveals novel therapeutic opportunities. Nat Commun. 13;11:5794. doi: 10.1038/s41467-020-19400-w.
Zubiría-Barrera C, Stock M, Neubert R, Vester A, Kulle A, Schneegans A, Leistner R, Gastmeier P, Slevogt H, Klassert TE (2020) A simple sequence-based filtering method for the removal of contaminants in low-biomass 16S rRNA amplicon sequencing approaches. J Microbiol MethodsActions;106060. doi: 10.1016/j.mimet.2020.106060.
Klassert TE, Zubiria-Barrera C, Kankel S, Stock M, Neubert R, Lorenzo-Diaz F, Doehring N, Driesch D, Fischer D, Slevogt H (2020) Early bacterial colonization and antibiotic resistance gene acquisition in newborns. Front Cell Infect Microbiol. 10:332. doi: 10.3389/fcimb.2020.00332
Machata S, Müller MM, Lehmann R, Sieber P, Panagiotou G, Carvalho A, Cunha C, Lagrou K, Maertens J, Slevogt H, Jacobsen ID (2020) Proteome analysis of bronchoalveolar lavage fluids reveals host and fungal proteins highly expressed during invasive pulmonary aspergillosis in mice and humans. Virulence 11(1):1337-1351. doi: 10.1080/21505594.2020.1824960.
Klaile E, Müller MM, Zubiría-Barrera C, Brehme S, Klassert TE, Stock M, Durotin A, Nguyen TD, Feer S, Singer BB, Zipfel PF, Rudolphi S, Jacobsen ID, Slevogt H (2019) Unaltered Fungal Burden and Lethality in Human CEACAM1-Transgenic Mice During Candida albicans Dissemination and Systemic Infection. Front Microbiol. 10:2703, doi: 10.3389/fmicb.2019.02703. eCollection 2019.

Herausragende Leistungen

Seit 2019 ist Prof. Slevogt berufenes Mitglied der Kommission Antiinfektiva, Resistenz und Therapie (ART) des Robert-Koch Instituts.
2019 war Prof. Slevogt Mitglied der Programmkommission für die gemeinsame Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Infektiologie (DGI) und des Deutschen Zentrums für Infektionsforschung (DZIF), “Infectious Diseases: Global Challenges and Future Strategies”, Bad Nauheim.
Seit 2019 ist Prof. Slevogt Mitglied des Editorial Boards der Zeitschrift „Respiratory Research“ (BMC, Springer).
2019 wurde Prof. Slevogt erneut in den Beirat der Deutschen Gesellschaft für Infektiologie (DGI) gewählt.