Forschung

Aktuelle Projekte

SFB 1278 Polytarget D02: Verpackungsoptimierung für antivirale und entzündungshemmende Wirkstoffe zur Behandlung von Infektionen der Atemwege durch Viren mit Pandemiepotential

https://www.polytarget.uni-jena.de/projekte/d02

Analysis of the newly discovered control of HSV-1 replication by the PP2A B-type subunit PR130

Mit Förderung der Deutschen Forschungsgemeinschaft: DFG Projektnummer 502534123

Projektleitung: Prof. Dr. Andreas Henke, Sektion für Experimentelle Virologie, Institut für Medizinische Mikrobiologie, Universitätsklinikum Jena; Prof. Dr. Oliver Krämer, Institut für Toxikologie, Universitätsmedizin Mainz

Zusammenfassung:

Die Phosphatase-2A (PP2A) B-Untereinheit PR130/PPP2R3A kontrolliert die Aktivierung von Checkpoint-Kinasen und steuert somit den Ablauf des Zellzyklus und die genomische Integrität der Zelle. Virusinfektionen induzieren DNA-Replikationsstress, DNA-Schäden und verursachen die Aktivierung dieser Kinasen. Da bislang unbekannt ist, ob der PP2A-PR130 Komplex virale Replikationsabläufe beeinflusst, wurde in enger Zusammenarbeit der Projektleiter dieses Forschungsvorhaben erfolgreich etabliert.

Bisherige Daten zeigen, dass PR130 die Replikation von Herpes-simplex-Virus Typ 1 (HSV-1) im Zellkern unterdrückt und die Phosphorylierung und Stabilität von Checkpoint-Kinasen in infizierten Zellen reguliert. Basierend auf dem CRISPR-Cas9 Verfahren wird nunmehr untersucht, inwiefern PR130 die HSV-1-verursachten Veränderungen des Zellzyklus und der DNA-Reparaturmechanismen moduliert. In diesem Kontext werden zelluläre und virale Proteine mittels Proteomik-Analysen bestimmt, die durch den PP2A-PR130-Komplex kontrolliert werden. Der Einfluss klinisch anwendbarer Checkpoint-Kinase-Inhibitoren auf die Virusreplikation wird in relevanten Zellkultursystemen analysiert. Darüber hinaus wird auch der Einfluss der PP2A B-Untereinheit B56β auf die Replikation von HSV-1 untersucht.

Da bislang keine Publikationen zum Einfluss von PR130 auf die Replikation viraler Infektionserreger existieren, werden die Ergebnisse der geplanten Experimente die bestehende Datenlage signifikant erweitern.

Projektlaufzeit: 01.01.2023-31.12.2025

PNEUTHERA - Quantitative monitoring of tailored therapy against bacterial super-infection in viral pneumonia by spatiotemporal microscopy

https://www.infectooptics.de/de/pneuthera.html

Charakterisierung des antiviralen und möglichen entzündungshemmenden Wirkmechanismus von ProcCluster® während Influenza Virus bzw. SARS-CoV-2 Infektion

Mit Förderung des EUROPÄISCHEN FONDS FÜR REGIONALE ENTWICKLUNG (EFRE-OP 2014-2020) als Teil der Reaktion der Union auf die COVID-19-Pandemie (REACT-EU)

Kooperationspartner: inflamed pharma GmbH Jena

Zusammenfassung:

Zirkulierende Viren, wie immer wieder neu auftretende Influenza A Viren oder Coronaviren, hierzu gehört das schwere akute Respiratorische Syndrom Corona Virus-2 (SARS-CoV-2), stellen nach wie vor eine globale Belastung für die öffentliche Gesundheit dar. Im Allgemeinen teilen Influenza A Viren und Coronaviren das Pandemiepotenzial. Die Entwicklung effizienter Impfstoffe ist zeitaufwendig und spezifische antivirale Behandlungsstrategien sind rar. Die Zulassung von Substanzen, die bereits klinisch für andere Krankheiten verwendet werden, sind kurzfristig eine vielversprechende Option zur Behandlung von Infektionen. Hierbei sind pharmazeutische Substanzen die Virus-unterstützende zelluläre Faktoren oder überschießende Immunreaktionen hemmen bzw. Entzündungsprozesse auflösen von besonderem Interesse. Erste Untersuchungen deuten auf eine hemmende Wirkung von ProcCluster®, einem Lokalanästhetikum mit entzündungshemmenden Eigenschaften, sowohl auf Influenza A Virus als auch auf SARS-CoV-2 Vermehrung und Verbreitung in vitro hin.

Während der Förderung durch den EUROPÄISCHEN FONDS FÜR REGIONALE ENTWICKLUNG – EUROPA FÜR THÜRINGEN werden in Kooperation mit der inflamed pharma GmbH Jena die Regulation der antiviralen und möglichen entzündungshemmenden Wirkung von ProcCluster® und ProcCluster®-haltigen Produkten während Influenza A Virus bzw. SARS-CoV-2 Infektion in vitro näher charakterisiert. Die Aufklärung der molekularen und regulatorischen Mechanismen von ProcCluster® und ProcCluster®-haltigen Produkten während viraler Infektion ist notwendig, um zunächst Grundlagen zur Einschätzung des Potentials von ProcCluster® und ProcCluster®-haltigen Produkten für eine spezifische Anwendbarkeit bei Influenza A Virus oder SARS-CoV-2 Infektion zu erhalten.

Publikation:

Häring, C.; Jungwirth, J.; Schroeder, J.; Löffler, B.; Engert, B.; Ehrhardt, C. The Local Anaesthetic Procaine Prodrugs ProcCluster® and Procaine Hydrochloride Impair SARS-CoV-2 Replication and Egress In Vitro. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 14584. https://doi.org/10.3390/ijms241914584
Häring C, Schroeder J, Jungwirth J, Löffler B, Henke A, Engert B and Ehrhardt C (2024) ProcCluster® and procaine hydrochloride inhibit the replication of influenza A virus in vitro. Front. Microbiol. 15:1422651.
https://doi.org/10.3389/fmicb.2024.1422651

COMDRUG-CoV-2: Die Wirkung häufig eingenommener Medikamente auf das alveolare Gleichgewicht während einer SARS-CoV-2-Infektion

Mit Förderung des BMBF

Zusammenfassung:

Ziel des Projektes ist es, unter Verwendung eines komplexen humanen Alveolus-on-a-Chip Modells, einem Modell, das Bedingungen der menschlichen Lunge nachahmt, die Pathophysiologie der SARS-CoV-2 Infektion zu untersuchen. Dabei soll die Wirkung von Substanzen gegen allgemeine Erkältungskrankheiten, Herz-Kreislauf-Erkrankungen und überschießende Immunantwort getestet werden. Insbesondere deren Wirkung auf Vermehrung und Verbreitung von SARS-CoV-2 im Epithel und Endothel, die Aktivierung von Entzündungsparametern und Schädigung der Zellbarrieren wird analysiert. Darüber hinaus werden SARS-CoV-2 induzierte Effekte auf Endothelzellen und die von diesen ausgehende Funktionen auf das vaskuläre System näher betrachtet, da dieses bei schweren COVID-19 Verläufen zu Blutgerinnungsstörungen und Thrombenbildung führen können.

Projektlaufzeit: 01.05.2020 bis 30.01.2022

Publikationen:

Deinhardt-Emmer S, Böttcher S, Häring C, Giebeler L, Henke A, Zell R, Jungwirth J, Jordan PM, Werz O, Hornung F, Brandt C, Marquet M, Mosig AS, Pletz MW, Schacke M, Rödel J, Heller R, Nietzsche S, Löffler B, Ehrhardt C. 2021. SARS-CoV-2 causes severe epithelial inflammation and barrier dysfunction. J Virol doi:10.1128/JVI.00110-21.
Jungwirth J, Häring C, König S, Giebeler L, Doshi H, Brandt C, Deinhardt-Emmer S, Löffler B, Ehrhardt C. 2022. D,L-Lysine-Acetylsalicylate + Glycine (LASAG) Reduces SARS-CoV-2 Replication and Shows an Additive Effect with Remdesivir. Int. J. Mol. Sci., 2022, 23 (13), 6880. https://doi.org/10.3390/ijms23136880 (registering DOI) - 21 Jun 2022

Infektiosität der Covid-19-Patienten über die Dauer der Erkrankung

Mit Förderung der Carl-Zeiss-Stiftung

Zusammenfassung:

Die Diagnostik einer Infektion mit SARS-CoV2 erfolgt über den Nachweis von genetischem Material des Virus mittels Reverse-Transkriptase-quantitativer Polymerase-Kettenreaktion (RT-qPCR). In Proben von COVID-19-Patienten lässt sich genetisches Material allerdings oft 14 Tage und länger nachweisen, obwohl die Patienten keine Symptome mehr zeigen. Die Infektiosität von COVID-19-Patienten kann über die Anzucht und Bestimmung infektiöser Viruspartikel in Zellkultursystemen mittels sog. Plaquetitration ermittelt werden. Diese Methode ist jedoch sehr zeitaufwendig und deshalb nicht für die Routinediagnostik geeignet. In dem Projekt werden beide Methoden eingesetzt, um über die Dauer der Erkrankung tatsächlich vorliegendes infektiöses Material zu ermitteln und mit den Werten der RT-qPCR zu vergleichen. Weiterhin ist es Ziel des Projektes eine Methode zu entwickeln, die den Nachweis von infektiösem Material auch in der Routinediagnostik erlaubt.

Projektlaufzeit: 01.05.2020 bis 30.01.2021

Publikation: Deinhardt-Emmer S, Wittschieber D, Sanft J, Kleemann S, Elschner S, Haupt KF, Vau V, Häring C, Rödel J, Henke A, Ehrhardt C, Bauer M, Philipp M, Gassler N, Nietzsche S, Löffler B, Mall G. 2021. Early postmortem mapping of SARS-CoV-2 RNA in patients with COVID-19 and the correlation with tissue damage. Elife 10: e60361.

Pressemitteilung

Infektiosität von Verstorbenen, die an Covid-19 erkrankt waren

Mit Förderung der Carl-Zeiss-Stiftung

Kooperationspartner:
Institut für Medizinische Mikrobiologie (Prof. Dr. Bettina Löffler)
und Institut für Rechtsmedizin (Prof. Dr. Gita Mall)

Zusammenfassung:

Es wird untersucht, ob in Verstorbenen infektiöse SARS-CoV2 nachweisbar sind und ob von diesen eine Gefährdung ausgeht. Da derzeit wenige Informationen diesbezüglich vorliegen, ist geplant, verschiedene Organe auf die potentielle Infektiosität zu untersuchen.

Projektlaufzeit: 01.05.2020 bis 30.01.2021

Pressemitteilung

Publikationen (2019 - 2024)

2019

Deinhardt-Emmer S, Haupt KF, Garcia-Moreno M, Geraci J, Forstner C, Pletz M, Ehrhardt C, Löffler B. 2019. Staphylococcus aureus Pneumonia: Preceding Influenza Infection Paves the Way for Low-Virulent Strains. Toxins (Basel) 11.
Dornfeld D, Petric PP, Hassan E, Zell R, Schwemmle M. 2019. Eurasian Avian-Like Swine Influenza A Viruses Escape Human MxA Restriction through Distinct Mutations in Their Nucleoprotein. Journal of Virology 93.
Egorova A, Ekins S, Schmidtke M, Makarov V. 2019. Back to the future: Advances in development of broad-spectrum capsid-binding inhibitors of enteroviruses. Eur J Med Chem 178:606-622.
Fu YG, Dürrwald R, Meng FD, Tong J, Wu NH, Su A, Yin XP, Haas L, Schmidtke M, Zell R, Krumbholz A, Herrler G. 2019. Infection Studies in Pigs and Porcine Airway Epithelial Cells Reveal an Evolution of A(H1N1)pdm09 Influenza A Viruses Toward Lower Virulence. Journal of Infectious Diseases 219:1596-1604.
Grienke U, Zwirchmayr J, Peintner U, Urban E, Zehl M, Schmidtke M, Rollinger JM. 2019. Lanostane Triterpenes from Gloeophyllum odoratum and Their Anti-Influenza Effects. Planta Med 85:195-202.
Krumbholz A, Roempke J, Liehr T, Groth M, Meerbach A, Schacke M, Maschkowitz G, Fickenscher H, Klapper W, Sauerbrei A, Wutzler P, Zell R. 2019. Macaca arctoides gammaherpesvirus 1 (strain herpesvirus Macaca arctoides): virus sequence, phylogeny and characterisation of virus-‐transformed macaque and rabbit cell lines. Medical Microbiology and Immunology 208(1) 109-129.
Pfaff F, Glück B, Hoyer T, Rohlander D, Sauerbrei A, Zell R. 2019. Tungsten carbide nanoparticles show a broad spectrum virucidal activity against enveloped and nonenveloped model viruses using a guideline-standardized in vitro test. Letters in Applied Microbiology 69:302-309.
Preugschas HF, Hrincius ER, Mewis C, Tran GVQ, Ludwig S, Ehrhardt C. 2019. Late activation of the Raf/MEK/ERK pathway is required for translocation of the respiratory syncytial virus F protein to the plasma membrane and efficient viral replication. Cell Microbiol 21:e12955.
Raja V, Salsaa M, Joshi AS, Li Y, van Roermund CWT, Saadat N, Lazcano P, Schmidtke M, Huttemann M, Gupta SV, Wanders RJA, Greenberg ML. 2019. Cardiolipin-deficient cells depend on anaplerotic pathways to ameliorate defective TCA cycle function. Biochim Biophys Acta Mol Cell Biol Lipids 1864:654-661.
Schloer S, Hubel N, Masemann D, Pajonczyk D, Brunotte L, Ehrhardt C, Brandenburg LO, Ludwig S, Gerke V, Rescher U. 2019. The annexin A1/FPR2 signaling axis expands alveolar macrophages, limits viral replication, and attenuates pathogenesis in the murine influenza A virus infection model. FASEB J 33:12188-12199.
Wald J, Pasin M, Richter M, Walther C, Mathai N, Kirchmair J, Makarov VA, Goessweiner-Mohr N, Marlovits TC, Zanella I, Real-Hohn A, Verdaguer N, Blaas D, Schmidtke M. 2019. Cryo-EM structure of pleconaril-resistant rhinovirus-B5 complexed to the antiviral OBR-5-340 reveals unexpected binding site. Proc Natl Acad Sci U S A 116:19109-19115.
Yinda CK, Esefeld J, Peter HU, Matthijnssens J, Zell R. 2019. Penguin megrivirus, a novel picornavirus from an Adelie penguin (Pygoscelis adeliae). Archives of Virology 164:2887-2890.
Zell R, Groth M, Krumbholz A, Lange J, Philipps A, Dürrwald R. 2019. Displacement of the Gent/1999 human-like swine H1N2 influenza A virus lineage by novel H1N2 reassortants in Germany. Archives of Virology 165(1) 55-67.

2020

Bohm K, Strompl J, Krumbholz A, Zell R, Krause G, Sievers C. 2020. Establishment of a Highly Sensitive Assay for Detection of Hepatitis E Virus-Specific Immunoglobulins. Journal of Clinical Microbiology 58.
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Chayrov R, Parisis NA, Chatziathanasiadou MV, Vrontaki E, Moschovou K, Melagraki G, Sbirkova-Dimitrova H, Shivachev B, Schmidtke M, Mitrev Y, Sticha M, Mavromoustakos T, Tzakos AG, Stankova I. 2020. Synthetic Analogues of Aminoadamantane as Influenza Viral Inhibitors-In Vitro, In Silico and QSAR Studies. Molecules 25.
Dastjerdi A, Benfield C, Everest D, Stidworthy MF, Zell R. 2020. Novel enteric viruses in fatal enteritis of grey squirrels. Journal of General Virology 101:746-750.
Deckert V, Deckert-Gaudig T, Cialla-May D, Popp J, Zell R, Deinhardt-Emmer S, Sokolov AV, Yi Z, Scully MO. 2020. Laser spectroscopic technique for direct identification of a single virus I: Faster CARS. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Nov 10;117(45):27820-27824.
Deinhardt-Emmer S, Rennert K, Schicke E, Cseresnyes Z, Windolph M, Nietzsche S, Heller R, Siwczak F, Haupt KF, Carlstedt S, Schacke M, Figge MT, Ehrhardt C, Löffler B, Mosig AS. 2020. Co-infection with Staphylococcus aureus after primary influenza virus infection leads to damage of the endothelium in a human alveolus-on-a-chip model. Biofabrication 12:025012.
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Schicke E, Cseresnyes Z, Rennert K, Vau V, Haupt KF, Hornung F, Nietzsche S, Swiczak F, Schmidtke M, Glück B, Koch M, Schacke M, Heller R, Mosig AS, Figge MT, Ehrhardt C, Löffler B, Deinhardt-Emmer S. 2020. Staphylococcus aureus Lung Infection Results in Down-Regulation of Surfactant Protein-A Mainly Caused by Pro-Inflammatory Macrophages. Microorganisms 8.
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Tzitzoglaki C, McGuire K, Lagarias P, Konstantinidi A, Hoffmann A, Fokina NA, Ma C, Papanastasiou IP, Schreiner PR, Vazquez S, Schmidtke M, Wang J, Busath DD, Kolocouris A. 2020. Chemical Probes for Blocking of Influenza A M2 Wild-type and S31N Channels. ACS Chem Biol 15:2331-2337.
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Wilden JJ, Hrincius ER, Niemann S, Boergeling Y, Löffler B, Ludwig S, Ehrhardt C. 2020. Impact of Staphylococcus aureus Small Colony Variants on Human Lung Epithelial Cells with Subsequent Influnenza Virus Infection. Microorganisms. 2020 Dec 15;8(12):1998.
Wilden JJ, van Krüchten A, Gieselmann L, Hrincius ER, Deinhardt-Emmer S, Haupt KF, Preugschas HF, Niemann S, Ludwig S, Ehrhardt C. 2020. The influenza replication blocking inhibitor LASAG does not sensitize human epithelial cells for bacterial infections. PLoS One 15:e0233052.
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2021

1. Batram M, Witte J, Schwarz M, Hain J, Ultsch B, Steinmann M, Bhavsar A, Wutzler P, Criée C-P, Hermann C, Wahle K, Füchtenbusch M, Greiner W. 2021. Burden of Herpes Zoster in Adult Patients with Underlying Conditions: Analysis of German Claims Data, 2007-2018. Dermatol Ther 11(3):1009-1026, doi: 10.1007/s13555-021-00535-7.

2. Dastjerdi A, Everest DJ, Davies H, Denk D, Zell R. 2021. A novel dicistrovirus in a captive red squirrel (Sciurus vulgaris). J Gen Virol 102.

3. Deinhardt-Emmer S, Böttcher S, Häring C, Giebeler L, Henke A, Zell R, Jungwirth J, Jordan PM, Werz O, Hornung F, Brandt C, Marquet M, Mosig AS, Pletz MW, Schacke M, Rödel J, Heller R, Nietzsche S, Löffler B, Ehrhardt C. 2021. SARS-CoV-2 causes severe epithelial inflammation and barrier dysfunction. J Virol doi:10.1128/JVI.00110-21.

4. Deinhardt-Emmer S, Jäckel L, Häring C, Böttcher S, Wilden JJ, Glück B, Heller R, Schmidtke M, Koch M, Löffler B, Ludwig S, Ehrhardt C. 2021. Inhibition of Phosphatidylinositol 3-Kinase by Pictilisib Blocks Influenza Virus Propagation in Cells and in Lungs of Infected Mice. Biomolecules 11.

5. Deinhardt-Emmer S, Wittschieber D, Sanft J, Kleemann S, Elschner S, Haupt KF, Vau V, Häring C, Rodel J, Henke A, Ehrhardt C, Bauer M, Philipp M, Gassler N, Nietzsche S, Löffler B, Mall G. 2021. Early postmortem mapping of SARS-CoV-2 RNA in patients with COVID-19 and the correlation with tissue damage. Elife 10.

6. Duwe SC, Schmidt B, Gartner BC, Timm J, Adams O, Fickenscher H, Schmidtke M. 2021. Prophylaxis and treatment of influenza: options, antiviral susceptibility, and existing recommendations. GMS Infect Dis 9:Doc02.

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Goder A, Ginter T, Heinzel T, Stroh S, Fahrer J, Henke A, Kramer OH. 2021. STAT1 N-terminal domain discriminatively controls type I and type II IFN signaling. Cytokine 144:155552.

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9. Stankova, I.G., Chayrov, R., Schmidtke, M., Danalev, D.L., Ognichenko, L.N., Artemenko, A.G., Shap-kin, V.A., Kuz'min, V.E. Quantitative structure-activity relationship modelling of influenza \M2 ion chan-nels inhibitors, Journal of the Serbian Chemical Society, 2021, 86 (7-8) , pp.625-637

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11. Wilden JJ, Jacob JC, Ehrhardt C, Ludwig S, Boergeling Y. 2021. Altered Signal Transduction in the Immune Response to Influenza Virus and S. pneumoniae or S. aureus Co-Infections. Int J Mol Sci 22.

12. Zell R, Knowles NJ, Simmonds P. 2021. A proposed division of the family Picornaviridae into subfamilies based on phylogenetic relationships and functional genomic organization. Arch Virol 166:2927-2935.

2022

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4. Jungwirth J, Häring C, König S, Giebeler L, Doshi H, Brandt C, Deinhardt-Emmer S, Löffler B, Ehrhardt C. 2022. D,L-Lysine-Acetylsalicylate + Glycine (LASAG) Reduces SARS-CoV-2 Replication and Shows an Additive Effect with Remdesivir. Int. J. Mol. Sci., 23 (13), 6880.

5. Wagner E, Tukhanova N, Shin A, Turebekov N, Shapiyeva Z, Shevtsov A, Nurmakhanov T, Sutyagin V, Berdibekov A, Maikanov N, Lezdinsh I, Freimüller K, Ehmann R, Ehrhardt C, Essbauer S, Peintner L. 2022. Incidence of tick‑borne spotted fever group Rickettsia species in rodents in two regions in Kazakhstan. Sci Rep. 12(1):14872. doi: 10.1038/s41598-022-19145-0.

6. Tukhanova N, Shin A, Turebekov N, Nurmakhanov T, Abdiyeva K, Shevtsov A, Yerubaev T, Tokmurziyeva G, Berdibekov A, Sutyagin V, Maikanov N, Zakharov A, Lezdinsh I, Yeraliyeva L, Froeschl G, Hoelscher M, Frey S, Wagner E, Peintner L, Essbauer S. Molecular Characterisation and Phylogeny of Tula Virus in Kazakhstan. Viruses. 2022 Jun 9;14(6):1258.

7. Shin A, Tukhanova N, Ndenkeh J Jr, Shapiyeva Z, Yegemberdiyeva R, Yeraliyeva L, Nurmakhanov T, Froeschl G, Hoelscher M, Musralina L, Toktasyn Y, Gulnara Z, Sansyzbayev Y, Aigul S, Abdiyeva K, Turebekov N, Wagner E, Peintner L, Essbauer S. Tick-borne encephalitis virus and West-Nile fever virus as causes of serous meningitis of unknown origin in Kazakhstan
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8. Langeder J, Döring K, Schmietendorf H, Grienke U, Schmidtke M, Rollinger JM. 1H NMR-Based Biochemometric Analysis of Morus alba Extracts toward a Multipotent Herbal Anti-Infective. J Nat Prod. 2022 Dec 21. doi: 10.1021/acs.jnatprod.2c00481. Online ahead of print.

9. Tzitzoglaki C, Hoffmann A, Turcu AL, Schmerer P, Laros G, Ma C, Liolios C, Wang J, Vázquez S, Schmidtke M, Kolocouris A. Amantadine variant – aryl conjugates that inhibit multiple M2 mutant – amantadine resistant influenza a viruses. Eur J Med Chem Reports, Volume 6, December 2022, 100083.

10. Zell R, Groth M, Selinka L, Selinka HC. Hepeliviruses in two waterbodies in Berlin, Germany. Arch Virol. 2022 Dec 25;168(1):9.

2023

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