AG Funktionelle Proteomanalyse
>> Forschungsschwerpunkt
Die Arbeitsgruppe „Funktionelle Proteomanalyse“ bringt umfangreiche methodische Expertise auf dem Gebiet der Proteomanalyse in das ThIMEDOP ein. Prof. Meier-Rosar untersucht mit Forschungsteams in der Onkologie das Proteom von Tumor- und Leukämiezellen, um die Heterogenität von Tumorzellen oder therapieresistente Leukämieformen besser zu verstehen. Entsprechend der jeweiligen biomedizinischen Fragestellungen wird die Methodik weiterentwickelt und ausgebaut und die funktionelle Proteomanalyse als Technologieplattform für translationale Forschung am Universitätsklinikum etabliert.
Publikationen
2024
Oliinyk D, Will A, Schneidmadel FR, Böhme M, Rinke J, Hochhaus A, Ernst T, Hahn N, Geis C, Lubeck M, Raether O, Humphrey SJ, Meier F. µPhos: a scalable and sensitive platform for high-dimensional phosphoproteomics. Mol Syst Biol. 2024 Jun 21. doi: 10.1038/s44320-024-00050-9. Epub ahead of print. PMID: 38907068.
2023
Michaelis AC, Brunner A, Zwiebel M, Meier F, Strauss MT, Bludau I & Mann M. The social and structural architecture of the yeast protein interactome. Nature (2023) https://doi.org/10.1038/s41586-023-06739-5
Will A, Oliinyk D, Bleiholder C, Meier F. Peptide collision cross sections of 22 post-translational modifications. Anal. Bioanal. Chem. (2023) https://doi.org/10.1007/s00216-023-04957-4
2022
Niu L, Thiele M, Geyer PE, Rasmussen DN, Webel HE, Santos A, Gupta R, Meier F, Strauss M, Kjaergaard M, Lindvig K, Jacobsen S, Rasmussen S, Hansen T, Krag A, Mann M. Noninvasive proteomic biomarkers for alcohol-related liver disease. Nat Med. 2022 Jun 2. doi: 10.1038/s41591-022-01850-y. Epub ahead of print. PMID: 35654907.
Liu FC, Kirk SR, Caldwell KA, Pedrete T, Meier F, Bleiholder C. Tandem Trapped Ion Mobility Spectrometry/Mass Spectrometry (tTIMS/MS) Reveals Sequence- Specific Determinants of Top-Down Protein Fragment Ion Cross Sections. Anal Chem. 2022 May 27. doi: 10.1021/acs.analchem.1c05171. Epub ahead of print. PMID: 35621336.
Skowronek P, Meier F. High-Throughput Mass Spectrometry-Based Proteomics with dia-PASEF. Methods Mol Biol. 2022;2456:15-27. doi: 10.1007/978-1-0716-2124-0_2. PMID: 35612732.
Niu L, Geyer PE, Gupta R, Santos A, Meier F, Doll S, Wewer Albrechtsen NJ, Klein S, Ortiz C, Uschner FE, Schierwagen R, Trebicka J, Mann M. Dynamic human liver proteome atlas reveals functional insights into disease pathways. Mol Syst Biol. 2022 May;18(5):e10947. doi: 10.15252/msb.202210947. PMID: 35579278; PMCID:PMC9112488.