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ThIMEDOP / Arbeitsgruppen des ThIMEDOP / AG Optisch-molekulare Diagnostik und Systemtechnologie
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Prof. Dr. Ralf Ehricht

AG Optisch-molekulare Diagnostik und Systemtechnologie

>> Forschungsschwerpunkte

  • Optische, molekulare und serologische Multiparameteranalysen für die klinisch-mikrobiologische Diagnostik und Epidemiologie
  • Schwerpunkt: Detektion und Verständnis von Antibiotikaresistenzen pathogener Bakterien
  • Assay-basierte Forschungsaktivitäten mit Hilfe modernster molekularer Technologien, wie digitaler PCR, real-time PCR, Next-Generation-Sequenzierung (NGS), Mikroarray-basierte und isothermale Analyseverfahren
  • Mikroarray-basierte Muliparameterserologie mittels Antikörperarrays, Antigenarrays und Peptidarrays
  • Bioinformatik für das molekulare Assaydesign und der Auswertung entsprechender Daten (z.B. NGS)
  • Translation bestehender und neuer Forschungsergebnisse in real verfügbare Produkte in Kooperation mit entsprechenden Partnern
  • Aufbau einer „Brücke“ zwischen akademischer Forschung zur Entwicklung neuer innovativer Assays mittels Systemtechnologie und Produktentwicklung und -realisierung mit kooperierenden Firmen der Diagnostikindustrie

DNS-basierte Multiparameterverfahren

Die Fachabteilung Ehricht hat ihre Arbeit am IPHT im Januar 2019 aufgenommen und vorher, in den vergangenen Jahren, wesentliche Erkenntnisse bei der Entwicklung und Anwendung verschiedenster molekularer Verfahrung für die Detektion, die Epidemiologie und das Verständnis von pathogenen Bakterien und deren Antibiotikaresistenzen (MRSA, ESBL, CRE, VRE u.a.) gewonnen. Dabei kamen vor allem Mikroarray-basierte Verfahren und eigens dafür entwickelte Plattformen zum Einsatz (Abbildung links), die in ihrer gesamten Breite über bioinformatisches Assaydesign, Oberflächenchemie, Fertigung, Testentwicklung, Bild- und Datenauswertung sowie spezifische Anwendungen reichte. Besonderes Augenmerk wurde einerseits auf die Implementierung dieser Forschungsergebnisse in real existierende Produkte und deren Evolution gelegt. Andererseits war ein Hauptfokus, Strategien und Verfahren für die optimale Probenvorbereitung zu erarbeiten und in komplexe Abläufe zu implementieren.

Next-Generation-Sequenzierung – Ein Werkzeug zur Entwicklung von Schnelltests

Die von Oxford Nanopore Technologies (Oxford, UK) entwickelte Plattform MinION wird mit ihrer Porentechnologie als der nächste Schritt der Next-Generation-Sequenzierung betrachtet (Abbíldung rechts). Die MinION Technologie basiert auf membrangebundene Protein-Nanoporen. Liegt eine Spannung an dieser Membran an, wird ein Ionenstrom durch die Poren generiert. Passiert ein DNA-Strang die Pore kommt es zu Spannungsänderungen, welche gemessen und später zu Nukleotiden umgerechnet werden. Je Pore können bis zu 400 Nukleotide pro Sekunde gemessen werden, was pro Genom zu Ausgaben von bis zu zwei Gigabasen führen kann. Einzelne Reads können Längen von 50.000-100.000 Basen erreichen. Daher ist es möglich speziell bakterielle Genome einfach und schnell zu analysieren und zu charakterisieren.

Was die Plattform so attraktiv macht, ist ihr vergleichbar günstiger Preis und die kompakte Größe. Die AG Ehricht will daher diese Technologie nutzen, neue bahnbrechende Assays auf molekularer Basis zu entwickeln. Allerdings werden auch andere Methoden der Next-Generation-Sequenzierung (z.B. MySeq, Illumina) etabliert und angewandt.

Protein- und Peptid-basierte Multiparameterverfahren

Routinemäßig werden Tests für verschiedene Antigene getrennt und nacheinander durchgeführt, was zu hohen Kosten und zeitlich verzögerten Ergebnissen führt. Außerdem wird eine relativ große Menge an Probe benötigt. Die AG Ehricht konnte belegen, dass die Multiparameter-Serologie mit Protein- und Peptidmikroarrays realisierbar ist. So konnte der IgG-Status und Impfstatus für 30 Erreger parallel und aus 1 µl und einer Gesamtzeit von 2h bestimmt werden (Abbildung unten). Das gleiche Verfahren könnte in Zukunft nicht nur für diagnostische Zwecke, sondern auch für die Testentwicklung (Antigen- und Antikörperscreening) eingesetzt werden. Das Panel der Antigene kann schnell an andere Anwendungen angepasst werden und auch auf Point-of-Care Plattformen wie Lateral Flow übertragen werden.

 

>> Projekte

Aktuelle Projekte

RESISTOVAC  Rapid and economical POC tests for determination of immune status and bacterial resistance factors

ADA Adaptierbare dezentrale Diagnostik für die Tier- und Humanmedizin

AVATAR Anonymisierung persönlicher Gesundheitsdaten durch Erzeugung digitaler Avatare in Medizin und Pflege

VRE-DETEKT Molekulare Mikroarrayplattform zur raschen Erkennung und Charakterisierung vancomycin-resistenter Enterokokken

RESISTOVAC Testformate zur schnellen Erfassung des Impfstatus

SANGUINE  Diagnostik von Blut- und Knochenmarkkrebs

AMPEL „Untersuchung synergistischer Effekte von membran-aktiven Peptiden und klassischen Antibiotika

Innovative molekulare und biochemische Assays für Schnelldiagnostik, Drug Development und neue Therapiekonzepte

frühere Projekte:

ResiCheck Test-Entwicklung zum Nachweis modifizierter Penizillin Bindeproteine in klinischen MRSA-Isolaten

DRESI Schnelle und präzise Diagnostik und Resistenzprüfung von Erregern der Sepsis auf der Intensivstation

DIGLEBEN Digitalisierung der Lebenswissenschaften

MULTIHOLODIAG Multiparameter-Analysen mit optisch-holografischen Verfahren für die medizinische Diagnostik

Erkennung unterschiedlicher Carbapenemasen Nachweis carbapenemase-bildender Erreger und deren Produkte

Publikationen

2023:

  1. Szumlanski T, Neumann B, Bertram R, Simbeck A, Ziegler R, Monecke S, Ehricht R, Schneider-Brachert W, Steinmann J. (2023) Characterization of PVL-Positive MRSA Isolates in Northern Bavaria, Germany over an Eight-Year Period. Microorganisms. 2022 Dec 24;11(1):54. doi: 10.3390/microorganisms11010054.
  2. Monecke S, Bedewy AK, Müller E, Braun SD, Diezel C, Elsheredy A, Kader O, Reinicke M, Ghazal A, Rezk S, Ehricht R. (2023) Characterisation of Methicillin- Resistant Staphylococcus aureus from Alexandria, Egypt. Antibiotics (Basel). 2023 Jan 1;12(1):78. doi: 10.3390/antibiotics12010078.
  3. Wagner GE, Berner A, Lipp M, Kohler C, Assig K, Lichtenegger S, Saqib M, Müller E, Trinh TT, Gad AM, Söffing HH, Ehricht R, Laroucau K, Steinmetz I. (2023) Protein Microarray-Guided Development of a Highly Sensitive and Specific Dipstick Assay for Glanders Serodiagnostics. J Clin Microbiol. 2023 Jan 26;61(1):e0123422. doi: 10.1128/jcm.01234-22.
  4. Aloba BK, Kinnevey PM, Monecke S, Brennan GI, O'Connell B, Blomfeldt A, McManus BA, Schneider-Brachert W, Tkadlec J, Ehricht R, Senok A, Bartels MD, Coleman DC. (2023) An emerging Panton-Valentine leukocidin-positive CC5-meticillin- resistant Staphylococcus aureus-IVc clone recovered from hospital and community settings over a 17-year period from 12 countries investigated by whole-genome sequencing. J Hosp Infect. 2023 Feb;132:8-19. doi: 10.1016/j.jhin.2022.11.015
  5. Wagner GE, Dabernig-Heinz J, Lipp M, Cabal A, Simantzik J, Kohl M, Scheiber M, Lichtenegger S, Ehricht R, Leitner E, Ruppitsch W, Steinmetz I. (2023) Real-Time Nanopore Q20+ Sequencing Enables Extremely Fast and Accurate Core Genome MLST Typing and Democratizes Access to High-Resolution Bacterial Pathogen Surveillance. J Clin Microbiol. 2023 Apr 20;61(4):e0163122. doi: 10.1128/jcm.01631-22.
  6. Burgold-Voigt S, Monecke S, Busch A, Bocklisch H, Braun SD, Diezel C, Hotzel H, Liebler-Tenorio EM, Müller E, Reinicke M, Reissig A, Ruppelt-Lorz A, Ehricht R. (2023) Characterisation of a <i>Staphylococcus aureus</i> Isolate Carrying Phage-Borne Enterotoxin E from a European Badger (Meles meles). Pathogens. 2023 May 12;12(5):704. doi: 10.3390/pathogens12050704.
  7. Pahlow S, Richard-Lacroix M, Hornung F, Köse-Vogel N, Mayerhöfer TG, Hniopek J, Ryabchykov O, Bocklitz T, Weber K, Ehricht R, Löffler B, Deinhardt-Emmer S, Popp J. (2023) Simple, Fast and Convenient Magnetic Bead-Based Sample Preparation for Detecting Viruses via Raman-Spectroscopy. Biosensors (Basel). 2023 May 30;13(6):594. doi: 10.3390/bios13060594.
  8. Monecke S, Akpaka PE, Smith MR, Unakal CG, Thoms Rodriguez CA, Ashraph K, Müller E, Braun SD, Diezel C, Reinicke M, Ehricht R. (2023) Clonal Complexes Distribution of Staphylococcus aureus Isolates from Clinical Samples from the Caribbean Islands. Antibiotics (Basel). 2023 Jun 14;12(6):1050. doi: 10.3390/antibiotics12061050.
  9. Bhat VJ, Blaschke D, Müller E, Ehricht R, Schmidt H. (2023) A Novel Approach to Monitor the Concentration of Phosphate Buffers in the Range of 1 M to 0.1 M Using a Silicon-Based Impedance Sensor. Biosensors (Basel). 2023 Aug 24;13(9):841. doi: 10.3390/bios13090841.
  10. Braun SD, Asif M, Hassan L, Ul Haq I, Abbasi SA, Jamil B, Monecke S, Ehricht R, Mueller E, Syed MA.(2023) Analysis of carbapenem-resistant strains isolated in a tertiary care hospital in Rawalpindi, Pakistan, during the years 2016 and 2020. J Hosp Infect. 2023 Nov;141:187-189. doi: 10.1016/j.jhin.2023.06.007.
  11. Moawad AA, El-Adawy H, Linde J, Jost I, Gärtner T, Hruschka K, Donat K, Neubauer H, Monecke S, Tomaso H (2023) Whole genome sequence-based analysis of Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis in Thuringia, Germany Front. Microbiol., 25 August 2023 Sec. Antimicrobials, Resistance and Chemotherapy, doi: 10.3389/fmicb.2023.1216850
  12. Osadare IE, Xiong L, Rubio I, Neugebauer U, Press AT, Ramoji A, Popp J. (2023) Raman Spectroscopy Profiling of Splenic T-Cells in Sepsis and Endotoxemia in Mice Int J Mol Sci 2023 Jul 27;24(15):12027. doi: 10.3390/ijms241512027. PMID: 37569403 PMCID: PMC10419286 DOI: 10.3390/ijms241512027
  13. Triebel S, Sachse K, Weber M, Heller M, Diezel C, Hölzer M, Schnee C, Marz M. (2023) De novo genome assembly resolving repetitive structures enables genomic analysis of 35 European Mycoplasmopsis bovis strains. BMC Genomics  2023 Sep 16;24(1):548. doi: 10.1186/s12864-023-09618-5.
  14. Loncaric I, Keinprecht H, Irimaso E, Cabal-Rosel A, Stessl B, Ntakirutimana C, Marek L, Fischer O, Szostak M, Oberrauch C, Wittek T, Müller E, Desvars A, Feßler A, Braun S, Schwarz, S, Ehling-Schultz M, Monecke S, Ehricht R, Ruppitsch W, Grunert T, Spergser J. (2023) Diversity of Staphylococcus aureus isolated from nares of ruminants Journal of Applied Microbiology - Decision on Manuscript ID JAMICRO-2023-0994.R1

2022:

  1. Monecke S, Feßler AT, Burgold-Voigt S, Krüger H, Mühldorfer K, Wibbelt G, Liebler-Tenorio EM, Reinicke M, Braun SD, Hanke D, Diezel C, Müller E, Loncaric I, Schwarz S, Ehricht R. (2021) Staphylococcus aureus isolates from Eurasian Beavers (Castor fiber) carry a novel phage-borne bicomponent leukocidin related to the Panton-Valentine leukocidin. Sci Rep. 2021 Dec 22;11(1):24394. doi: 10.1038/s41598-021-03823-6.
  2. Tsilipounidaki K, Athanasakopoulou Z, Müller E, Burgold-Voigt S, Florou Z, Braun SD, Monecke S, Gatselis NK, Zachou K, Stefos A, Tsagalas I, Sofia M, Spyrou V, Billinis C, Dalekos GN, Ehricht R, Petinaki E. (2022) Plethora of Resistance Genes in Carbapenem-Resistant Gram-Negative Bacteria in Greece: No End to a Continuous Genetic Evolution. Microorganisms. 2022 Jan 13;10(1):159. doi: 10.3390/microorganisms10010159.
  3. El-Ashker M, Monecke S, Gwida M, Saad T, El-Gohary A, Mohamed A, Reißig A, Frankenfeld K, Gary D, Müller E, Ehricht R. (2022) Molecular characterisation of methicillin-resistant and methicillin-susceptible Staphylococcus aureus clones isolated from healthy dairy animals and their caretakers in Egypt. Vet Microbiol. 2022 Apr;267:109374. doi: 10.1016/j.vetmic.2022.109374. Epub 2022 Feb
  4. Luzzago C, Lauzi S, Ehricht R, Monecke S, Corlatti L, Pedrotti L, Piccinini R. Survey of Staphylococcus aureus carriage by free-living red deer (Cervus elaphus): Evidence of human and domestic animal lineages. (2022) Transbound Emerg Dis. 2022 Sep;69(5):e1659-e1669. doi: 10.1111/tbed.14500. Epub 2022 Mar 22.
  5. Marquet M, Zöllkau J, Pastuschek J, Viehweger A, Schleußner E, Makarewicz O, Pletz MW, Ehricht R, Brandt C. Evaluation of microbiome enrichment and host DNA depletion in human vaginal samples using Oxford Nanopore's adaptive sequencing. (2022) Sci Rep. 2022 Mar 7;12(1):4000. doi: 10.1038/s41598-022-08003-8.
  6. Finsterwalder SK, Loncaric I, Cabal A, Szostak MP, Barf LM, Marz M, Allerberger F, Burgener IA, Tichy A, Feßler AT, Schwarz S, Monecke S, Ehricht R, Ruppitsch W, Spergser J, Künzel F. (2022) Dogs as carriers of virulent and resistant genotypes of Clostridioides difficile. Zoonoses Public Health. 2022 Sep;69(6):673-681. doi: 10.1111/zph.12956. Epub 2022 May 12. PMID: 35546073;
  7. Burgold-Voigt S, Müller E, Zopf D, Monecke S, Braun SD, Frankenfeld K, Kiehntopf M, Weis S, Schumacher T, Pletz MW, Ehricht R; CoNAN Study Group. Development of a new antigen-based microarray platform for screening and detection of human IgG antibodies against SARS-CoV-2. (2022) Sci Rep. 2022 May 16;12(1):8067. doi: 10.1038/s41598-022-10823-7.
  8. Monecke S, Schaumburg F, Shittu AO, Schwarz S, Mühldorfer K, Brandt C, Braun SD, Collatz M, Diezel C, Gawlik D, Hanke D, Hotzel H, Müller E, Reinicke M, Feßler AT, Ehricht R. (2022) Description of Staphylococcal Strains from Straw-Coloured Fruit Bat (Eidolon helvum) and Diamond Firetail (Stagonopleura guttata) and a Review of their Phylogenetic Relationships to Other Staphylococci. Front Cell Infect Microbiol. 2022 May 11;12:878137. doi: 10.3389/fcimb.2022.878137.
  9. Tsekouras N, Athanasakopoulou Z, Diezel C, Kostoulas P, Braun SD, Sofia M, Monecke S, Ehricht R, Chatzopoulos DC, Gary D, Krähmer D, Spyrou V, Christodoulopoulos G, Billinis C, Papatsiros VG. (2022) Cross-Sectional Survey of Antibiotic Resistance in Extended Spectrum β-Lactamase-Producing Enterobacteriaceae Isolated from Pigs in Greece. (2022) Animals (Basel). 2022 Jun 16;12(12):1560. doi: 10.3390/ani12121560.
  10. Athanasakopoulou Z, Diezel C, Braun SD, Sofia M, Giannakopoulos A, Monecke S, Gary D, Krähmer D, Chatzopoulos DC, Touloudi A, Birtsas P, Palli M, Georgakopoulos G, Spyrou V, Petinaki E, Ehricht R, Billinis C. (2022) Occurrence and Characteristics of ESBL- and Carbapenemase- Producing Escherichia coli from Wild and Feral Birds in Greece. Microorganisms. 2022 Jun 14;10(6):1217. doi: 10.3390/microorganisms10061217.
  11. Pistiki A, Monecke S, Shen H, Ryabchykov O, Bocklitz TW, Rösch P, Ehricht R, Popp J. (2022) Comparison of Different Label-Free Raman Spectroscopy Approaches for the Discrimination of Clinical MRSA and MSSA Isolates. (2022) Microbiol Spectr. 2022 Oct 26;10(5):e0076322. doi: 10.1128/spectrum.00763-22. Epub 2022 Aug 25.
  12. Moawad AA, Hotzel H, Hafez HM, Ramadan H, Tomaso H, Braun SD, Ehricht R, Diezel C, Gary D, Engelmann I, Zakaria IM, Reda RM, Eid S, Shahien MA, Neubauer H, Monecke S. (2022) Occurrence, Phenotypic and Molecular Characteristics of Extended- Spectrum Beta-Lactamase-Producing Escherichia coli in Healthy Turkeys in Northern Egypt. Antibiotics (Basel). 2022 Aug 8;11(8):1075. doi: 10.3390/antibiotics11081075.
  13. Monecke S, Roberts MC, Braun SD, Diezel C, Müller E, Reinicke M, Linde J, Joshi PR, Paudel S, Acharya M, Chalise MK, Feßler AT, Hotzel H, Khanal L, Koju NP, Schwarz S, Kyes RC, Ehricht R. (2022) Sequence Analysis of Novel Staphylococcus aureus Lineages from Wild and Captive Macaques. (2022) Int J Mol Sci. 2022 Sep 23;23(19):11225. doi: 10.3390/ijms231911225.
  14. Steinig E, Aglua I, Duchene S, Meehan MT, Yoannes M, Firth C, Jaworski J, Drekore J, Urakoko B, Poka H, Wurr C, Ebos E, Nangen D, Müller E, Mulvey P, Jackson C, Blomfeldt A, Aamot HV, Laman M, Manning L, Earls M, Coleman DC, Greenhill A, Ford R, Stegger M, Syed MA, Jamil B, Monecke S, Ehricht R, Smith S, Pomat W, Horwood P, Tong SYC, McBryde E. (2022) Phylodynamic signatures in the emergence of community-associated MRSA. Proc Natl Acad Sci U S A. 2022 Nov 8;119(45):e2204993119. doi: 10.1073/pnas.2204993119. Epub 2022 Nov 2.
  15. Marquet M, Hölzer M, Pletz MW, Viehweger A, Makarewicz O, Ehricht R, Brandt C. (2022) What the Phage: a scalable workflow for the identification and analysis of phage sequences. Gigascience. 2022 Nov 18;11:giac110. doi: 10.1093/gigascience/giac110.
  16. Aloba BK, Kinnevey PM, Monecke S, Brennan GI, O'Connell B, Blomfeldt A, McManus BA, Schneider-Brachert W, Tkadlec J, Ehricht R, Senok A, Bartels MD, Coleman DC. (2022) An emerging Panton-Valentine leukocidin (PVL)-positive CC5-meticillin-resistant Staphylococcus aureus-IVc clone recovered from hospital and community settings over a 17-year period from 12 countries investigated by whole-genome sequencing. J Hosp Infect. 2022 Dec 5:S0195-6701(22)00369-3. doi: 10.1016/j.jhin.2022.11.015. Epub ahead of print.
  17. Collatz M, Braun SD, Monecke S and Ehricht R (2022); ConsensusPrime—A Bioinformatic Pipeline for Ideal Consensus Primer Design.; BioMedInformatics 2022, 2(4), 637-642; doi: 10.3390/biomedinformatics2040041
  18. Akarsu H, Liljander A, Younan M, Brodard I, Overesch G, Glücks I, Labroussaa F, Kuhnert P, Perreten V, Monecke S, Drexler JF, Corman VM, Falquet L, Jores J. (2022) Genomic Characterization and Antimicrobial Susceptibility of Dromedary- Associated Staphylococcaceae from the Horn of Africa. Appl Environ Microbiol. 2022 Nov 8;88(21):e0114622. doi: 10.1128/aem.01146-22. Epub 2022 Oct 13.
  19. Engler C, Renna MS, Beccaria C, Silvestrini P, Pirola SI, Pereyra EAL, Baravalle C, Camussone CM, Monecke S, Calvinho LF, Dallard BE. Differential immune response to two Staphylococcus aureus strains with distinct adaptation genotypes after experimental intramammary infection of dairy cows. Microb Pathog. 2022 Nov;172:105789. doi: 10.1016/j.micpath.2022.105789. Epub 2022 Sep 20.

2021:

  1. Ibadan, Nigeria. Fashae K, Engelmann I, Monecke S, Braun SD, Ehricht R. Molecular characterisation of extended-spectrum ß-lactamase producing Escherichia coli in wild birds and cattle, BMC Vet Res. 2021 Jan 18;17(1):33. doi: 10.1186/s12917-020-02734-4. PMID: 33461554
  2. McManus BA, Aloba BK, Earls MR, Brennan GI, O'Connell B, Monecke S, Ehricht R, Shore AC, Coleman DC. Multiple distinct outbreaks of Panton-Valentine leucocidin-positive community-associated meticillin-resistant Staphylococcus aureus in Ireland investigated by whole-genome sequencing. J Hosp Infect. 2021 Feb;108:72-80. doi: 10.1016/j.jhin.2020.11.021. Epub 2020 Nov 28. PMID: 33259881
  3. Bernreiter-Hofer T, Schwarz L, Müller E, Cabal-Rosel A, Korus M, Misic D, Frankenfeld K, Abraham K, Grünzweil O, Weiss A, Feßler AT, Allerberger F, Schwarz S, Szostak MP, Ruppitsch W, Ladinig A, Spergser J, Braun SD, Monecke S, Ehricht R, Loncaric I. The Pheno- and Genotypic Characterization of Porcine Escherichia coli Isolates. 2021 Aug 6;9(8):1676. doi: 10.3390/microorganisms9081676. PMID: 34442755
  4. Grünzweil OM, Palmer L, Cabal A, Szostak MP, Ruppitsch W, Kornschober C, Korus M, Misic D, Bernreiter-Hofer T, Korath ADJ, Feßler AT, Allerberger F, Schwarz S, Spergser J, Müller E, Braun SD, Monecke S, Ehricht R, Walzer C, Smodlaka H, Loncaric I. Presence of β-Lactamase-producing Enterobacterales and Salmonella Isolates in Marine Mammals. Int J Mol Sci. 2021 May 31;22(11):5905. doi: 10.3390/ijms22115905. PMID: 34072783
  5. Borg MA, Monecke S, Haider J, Müller E, Reissig A, Ehricht R. MRSA improvement within a highly endemic hospital in Malta: infection control measures or clonal change? J Hosp Infect. 2021 Apr; 110:201-202. doi: 10.1016/j.jhin.2021.02.003. Epub 2021 Feb 9. PMID: 33577835 No abstract available.
  6. Mišić D, Kiskaroly F, Szostak MP, Cabal A, Ruppitsch W, Bernreiter-Hofer T, Milovanovic V, Feßler AT, Allerberger F, Spergser J, Müller E, Schwarz S, Braun SD, Monecke S, Ehricht R, Korus M, Benković D, Korzeniowska M, Loncaric I. The First Report of mcr-1-Carrying Escherichia coli Originating from Animals in Serbi Antibiotics (Basel). 2021 Sep 3;10(9):1063. doi: 10.3390/antibiotics10091063. PMID: 34572647
  7. Athanasakopoulou Z, Reinicke M, Diezel C, Sofia M, Chatzopoulos DC, Braun SD, Reissig A, Spyrou V, Monecke S, Ehricht R, Tsilipounidaki K, Giannakopoulos A, Petinaki E, Billinis C. Antimicrobial Resistance Genes in ESBL-Producing Escherichia coli Isolates from Animals in Greece. Antibiotics (Basel). 2021 Apr 4;10(4):389. doi: 10.3390/antibiotics10040389. PMID: 33916633 Free PMC article.
  8. Achek R, El-Adawy H, Hotzel H, Hendam A, Tomaso H, Ehricht R, Neubauer H, Nabi I, Hamdi TM, Monecke S. Molecular Characterization of Staphylococcus aureus Isolated from Human and Food Samples in Northern Algeria. 2021 Oct 3;10(10):1276. doi: 10.3390/pathogens10101276. PMID: 34684225
  9. Senok A, Monecke S, Nassar R, Celiloglu H, Thyagarajan S, Müller E, Ehricht R. Lateral Flow Immunoassay for the Detection of Panton-Valentine Leukocidin in Staphylococcus aureus From Skin and Soft Tissue Infections in the United Arab Emirates. Front Cell Infect Microbiol. 2021 Oct 18;11:754523. doi: 10.3389/fcimb.2021.754523. eCollection 2021. PMID: 34733796
  10. Madzgalla S, Duering H, Hey JC, Neubauer S, Feller KH, Ehricht R, Pletz MW, Makarewicz O. Assessment of Phenotype Relevant Amino Acid Residues in TEM-β-Lactamases by Mathematical Modelling and Experimental Approval. 2021 Aug 13;9(8):1726. doi: 10.3390/microorganisms9081726. PMID: 34442804
  11. Monecke S, Müller E, Braun SD, Armengol-Porta M, Bes M, Boswihi S, El-Ashker M, Engelmann I, Gawlik D, Gwida M, Hotzel H, Nassar R, Reissig A, Ruppelt-Lorz A, Senok A, Somily AM, Udo EE, Ehricht R. Characterisation of S. aureus/MRSA CC1153 and review of mobile genetic elements carrying the fusidic acid resistance gene fusC. Sci Rep. 2021 Apr 14;11(1):8128. doi: 10.1038/s41598-021-86273-4. PMID: 33854075
  12. Sarkhoo E, Udo EE, Boswihi SS, Monecke S, Mueller E, Ehricht R. The Dissemination and Molecular Characterization of Clonal Complex 361 (CC361) Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Kuwait Hospitals. Front Microbiol. 2021 May 6;12:658772. doi: 10.3389/fmicb.2021.658772. eCollection 2021. PMID: 34025612
  13. Earls MR, Steinig EJ, Monecke S, Samaniego Castruita JA, Simbeck A, Schneider-Brachert W, Vremerǎ T, Dorneanu OS, Loncaric I, Bes M, Lacoma A, Prat Aymerich C, Wernery U, Armengol-Porta M, Blomfeldt A, Duchene S, Bartels MD, Ehricht R, Coleman DC. Exploring the evolution and epidemiology of European CC1-MRSA-IV: tracking a multidrug-resistant community-associated meticillin-resistant Staphylococcus aureus clone. Microb Genom. 2021 Jul;7(7):000601. doi: 10.1099/mgen.0.000601. PMID: 34223815
  14. . Sáez Moreno D, Visram Z, Mutti M, Restrepo-Córdoba M, Hartmann S, Kremers AI, Tišáková L, Schertler S, Wittmann J, Kalali B, Monecke S, Ehricht R, Resch G, Corsini L. ε2-Phages Are Naturally Bred and Have a Vastly Improved Host Range in Staphylococcus aureus over Wild Type Phages Pharmaceuticals (Basel). 2021 Apr 2;14(4):325. doi: 10.3390/ph14040325. PMID: 33918287
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