Die Zertifizierung der Klinik und Poliklinik für Urologie nach den Kriterien des Qualitätsmanagementsystems der DIN EN ISO 9001:2015 erfolgte erstmals im Jahr 2008 (letzte Rezertifizierung 06/2022).
Qualität
Die Zertifizierung der Klinik und Poliklinik für Urologie als Prostatakarzinomzentrum erfolgte erstmals im Jahr 2011 (seitdem erfolgreiche Rezertifizierungen, zuletzt 11/2021).
Die Zertifizierung der Klinik und Poliklinik für Urologie als Nierenzellkarzinomzentrum erfolgte erstmals im Jahr 2021.
Die Zertifizierung der Klinik und Poliklinik für Urologie als Uroonkologisches Zentrum erfolgte erstmals im Jahr 2021.
Die Urologische Universitätsklinik Jena erlangte 1997 die europäische Zertifizierung „European Certificate Center“ mit regelmäßigen Rezertifizierungen, zuletzt im Jahr 2019. Im Auftrag des European Board of Urology (EBU) erfolgte hierbei die Evaluierung durch eine Kommission von Professoren aus ganz Europa. Die Klinik ist damit zugleich EBU-zertifiziertes Ausbildungszentrum für Urologen.