Als kritische Infrastruktur und als Gesundheitsdaten verarbeitendes Unternehmen ist das Universitätsklinikum Jena besonderen Ansprüchen an das Informationsmanagement unterworfen. Der Geschäftsbereich IT nimmt hierfür Tätigkeiten im Bereich der IT-Sicherheit (Schutz der IT-Systeme gegen Bedrohungen) und des Datenschutzes (Schutz der verarbeiteten personenbezogenen Daten gegen missbräuchliche Verwendung) wahr.